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Panel-Ref? gDNA All-in-One Reference Standard(Discontinued)

CBP90012

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產(chǎn)品描述
產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫(kù)

這是一款針對(duì)大panel基因設(shè)定的參考品、質(zhì)控品、標(biāo)準(zhǔn)品,可用于檢測(cè)流程的QC驗(yàn)證,包含準(zhǔn)確性、重復(fù)性、檢測(cè)限

等,基 本信息如下:

產(chǎn)品形式:                                    gDNA

驗(yàn)證基因:                                    >400個(gè)

驗(yàn)證位點(diǎn):                                    >700個(gè)

對(duì)應(yīng)dbSNP ID:                              >400個(gè)

對(duì)應(yīng)Cosmic ID:                             >570個(gè)

驗(yàn)證平臺(tái):                                    NGS-Panel、DdPCR and WES 500X

%AF范圍:                                   1-100%

規(guī)格:                                            1ug/vial * 1 vial

保存溫度:                                    2-8°C

保質(zhì)期:                                        36個(gè)月

數(shù)據(jù)下載:                                    請(qǐng)?jiān)?ldquo;相關(guān)文件”中下載

 

MSI Inspection Data

 

產(chǎn)品特性:

1. 樣本來源于臨床分離建立的細(xì)胞系,非常接近臨床病人的特性;

2. 泛癌種,涉及多種腫瘤相關(guān)的基因:肺癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、胰腺癌、血液腫瘤、胃癌等等,部分基因羅列如下:


表1.  泛腫瘤相關(guān)靶向基因部分展示

3. 染色體全覆蓋,除了Y染色體外,其他染色體都有涉及

圖1.  在不同染色體編號(hào)上的位點(diǎn)數(shù)(經(jīng)過驗(yàn)證的位點(diǎn))

4. 變異種類多:涉及SNP,deletion,insertion,CNV等等;

圖2.  不同種類突變形式的位點(diǎn)數(shù)(經(jīng)過驗(yàn)證的位點(diǎn))

5. 突變頻率全覆蓋,從1%-100%,各區(qū)間都有涉及;

圖3.  不同突變頻率的位點(diǎn)數(shù)(經(jīng)過驗(yàn)證的位點(diǎn))

6. 突變類型全覆蓋,有UTR區(qū)域,有內(nèi)含子,有外顯子,有錯(cuò)義突變,有同義突變,有供體變異等等;

圖4.  突變細(xì)分種類的位點(diǎn)數(shù)(經(jīng)過驗(yàn)證的位點(diǎn))

7. 位點(diǎn)多,超過680個(gè)位點(diǎn),全部有對(duì)應(yīng)的Cosmic ID或/和dbSNP ID注釋;

圖5. 經(jīng)過dbSNP ID和Cosmic ID注釋的位點(diǎn)數(shù)(經(jīng)過驗(yàn)證的位點(diǎn))

8. 多平臺(tái)驗(yàn)證,數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可信賴;

8.1 其中1000x panel驗(yàn)證16個(gè)位點(diǎn),panel為知名商業(yè)化公司產(chǎn)品;

表2.  16個(gè)經(jīng)過1000x NGS-Panel試劑盒驗(yàn)證的位點(diǎn)信息

8.2 DdPCR驗(yàn)證8個(gè)位點(diǎn),Bio-Rad QX200和Bio-Rad原裝試劑

表3. 8個(gè)經(jīng)過DdPCR(bio-rad)試劑盒驗(yàn)證的位點(diǎn)信息

8.3 500X WES驗(yàn)證所有位點(diǎn),IDT xGenExome Research Panel v1.0捕獲,HiSeq X-TEN測(cè)序

表4. 500X WES驗(yàn)證的400個(gè)基因信息

9. 基因覆蓋科學(xué),超過400個(gè)基因,覆蓋國(guó)內(nèi)外多個(gè)知名panel的設(shè)計(jì);

表5. 基因覆蓋率比較

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